서두 RDKit을 사용할 때, Smiles, InChI형식 등에서 mol object를 만든 후 jupyter notebook 상에서 여러 분석을 할 수 있는 경우가 많다. 보통 필자는 python list에 여러개의 mol object를 넣고 관리 하며 작업한다. 본문 만약 매우 많은 수의 mol object를 저장해야 한다면? rdkit의 mol object다수 저장하는 형식이 .sdf 형식이다. END로 한 mol의 마지막이 표시되어 있고, $$$$로 구별을 한다. 다음 mol object가 붉은 네모박스 이외에도 계속 나열되어 있다. .sdf로 저장하려면 다음과 같이 하면 된다. #Import packages from rdkit import Chem #Do writer = Chem.SDWriter..
[Python][RDKit]mol object저장하기, 불러오기
서두 RDKit을 사용할 때, Smiles, InChI형식 등에서 mol object를 만든 후 jupyter notebook 상에서 여러 분석을 할 수 있는 경우가 많다. 보통 필자는 python list에 여러개의 mol object를 넣고 관리 하며 작업한다. 본문 만약 매우 많은 수의 mol object를 저장해야 한다면? rdkit의 mol object다수 저장하는 형식이 .sdf 형식이다. END로 한 mol의 마지막이 표시되어 있고, $$$$로 구별을 한다. 다음 mol object가 붉은 네모박스 이외에도 계속 나열되어 있다. .sdf로 저장하려면 다음과 같이 하면 된다. #Import packages from rdkit import Chem #Do writer = Chem.SDWriter..
2023.09.15